Ninja savaşçılar oyunu oynarken bilgisayarlarda sağ ve sol yön tuşlarını kullanarak dövüşçü karakterinizi sağa sola hareket ettiriyorsunuz. 'W, A, S, D' tuşlarıyla da rakibinize saldırı yapıyorsunuz ya da rakibin saldırılarına karşı savunma yapıyorsunuz. Cep telefonları ve mobil tabletlerde ise ekranın sol tarafındaki oklara tıklayarak karakterinizi sağa sola hareket ettiriyorsunuz. Sağ taraftaki butona tıklayarak da rakibinize saldırı yapıyorsunuz. Menü sayfasında MISSIONS, ARCADE, VERSUS ve TRAINING olmak üzere 4 tane seçenek bulunuyor. MISSIONS seçeneğinde tek seferlik dövüş yapıyorsunuz. ARCADE seçeneğinde 9 raundluk bir dövüş yapıyorsunuz. VERSUS seçeneğinde ise iki tane karakter seçiyorsunuz. Karşınıza çıkan 2 tane rakibe karşı mücadele ediyorsunuz. TRAINING seçeneğinde ise alıştırma yapıyorsunuz. CHOOSE A FIGHTER penceresinde 10 farklı dövüşçü bulunuyor. Buradan karakterinizi seçerek ninja kaplumbağalar oyunu oynamaya başlıyorsunuz. Ekranın üst tarafında her dövüşçünün kalan güçleri görünüyor. Gücü yada enerjisi biten karakter ölüyor ve maçı kaybediyor.