Zero Adventure oyunu oynarken bilgisayarlarda 'W, A, S, D' ve yön tuşlarıyla karakterinizi laboratuvarın içinde hareket ettiriyorsunuz. Fareyi sağa sola veya yukarı aşağı sürükleyerek görüş açınızı değiştiriyorsunuz. 'E' ile nesneleri elinize alıyorsunuz. Kapıları, dolapları ve çekmeceleri açıp kapatıyorsunuz. 'F' ile el fenerini açıp kapatıyorsunuz. Farenin sol tuşuna tıklayarak silahınızı ateşliyorsunuz. 'C' ile çömelip ayağa kalkıyorsunuz. SHIFT ile hızlı koşuyorsunuz. SPACE boşluk bırakma ile de havaya doğru zıplıyorsunuz. Cep telefonları ve mobil tabletlerde ise ekranın sol tarafındaki kontrol paneli üzerinde parmağınızı sürükleyerek karakterinizi evin içinde hareket ettiriyorsunuz. Ekranın sağ tarafında bulunan zıplama, koşma, çömelme, tutma ve lamba yakma tuşlarının üstüne tıklayarak kullanıyorsunuz. Ekranda görünen beyaz nokta elinizin kontrol ettiği bölgeyi gösteriyor. Bu nokta kapıların veya eşyaların üzerine denk geldiğinde elinizi kullanabiliyorsunuz. MEDIUM ve HARD olmak üzere 2 farklı zorluk derecesi bulunuyor. Laboratuvarda dolaşan yaratığın sessizliği ve hızı bölümün zorluk derecesine göre artıyor. Ayrıca zorluk derecesine göre kullanacağınız ip uçlarının sayısı da değişiyor. Önce ip uçlarını alıp kilitli olan kapıları teker teker açıyorsunuz. Peşinizden koşan yaratığa yakalanmadan çıkış kapısına ulaşıp dışarı kaçıyorsunuz. Kilitli kapıları açarken eğer elinizdeki ip ucu yanlış ise ekranda çıkan uyarı penceresinde kullanacağınız doğru ip ucu resmi görünüyor. Her defasında elinizde sadece bir tane nesne bulundurabiliyorsunuz. Specimen zero oyunu oynarken nesnelerin ve ip uçlarının yerlerini aklınızda tutmalısınız. Böylece lazım olan nesneyi hemen bularak çıkış kapısına bir an önce ulaşabilirsiniz. Kilitli kapıları açıp çıkış kapısına ulaşmaya çalışırken evin içindeki hayalet size saldırırsa ölüyorsunuz. Bu durumda aynı bölüme tekrardan başlamak zorunda kalıyorsunuz. Çıkış kapısına ulaşmak için önce kırmızı, mavi ve sarı anahtarları bulup kapıları açmalısınız. Sonra da laboratuvarın gizli bölmelerinde bulunan levye, kablo ve sigortayı kullanarak ana çıkış kapısını açarak dışarı kaçıyorsunuz.
